Trong vòng 100 năm qua, clo được sử dụng để khử trùng cho nước, phòng các bệnh lây lan do nước bị nhiễm bẩn. Tuy nhiên bên cạnh các ưu điểm như rẻ tiền, có sẵn và tiêu diệt có hiệu quả hầu hết các vi sinh vật gây bệnh, clo còn có một số nhược điểm mới được phát hiện ra.

Người ta đã phát hiện trihalogenua metanclolofom và các axit trihalogen axetic là các sản phẩm phụ của clo sinh ra do phản ứng của nó với các chất hữu cơ và vô cơ có trong nước. Các báo cáo gần đây cho biết có sự liên quan giữa các chất này với các dạng ung thư khác nhau.

Tại cuộc họp của ủy ban về Luật và các Sản phẩm của ngành cá (CCFFP) tiến hành vào năm 1998 tại Bergen (Nauy), người ta đã thảo luận về việc sử dụng clo làm chất khử trùng để hạn chế tác hại của vi khuẩn đối với các hải sản như tôm và các loại khác.

Theo quy định của luật hiện hành thì nồng độ clo trong nước dùng trực tiếp cho hải sản là 10mg/l, còn trong nước rửa các thiết bị chế biến là 100 mg/l.

Clo thương phẩm được sản xuất dưới một số dạng khác nhau: dạng hạt và bột như canxi hypoclorit, dạng dung dịch như natri hypoclorit (NaOCl). Riêng khí clo thì được nén thành dạng lỏng và chứa trong các bình chịu áp khi dùng thì sục vào nước. Clo là một chất oxy hóa rất mạnh và tác dụng với rất nhiều hợp chất. Clođioxit ít được sử dụng hơn vì không bền vững, khi vận chuyển và xử lý dễ gây độc hại nhưng khả năng diệt khuẩn lại cao gấp 7 lần so với clo lỏng. Ngoài ra clo đioxit lại không bị ảnh hưởng bởi môi trường kiềm và sự có mặt của các chất hữu cơ. Vậy hiện nay người ta đang nghiên cứu để có thể sử dụng nó trong chế biến hải sản.

Một nghiên cứu được tiến hành vào năm 1982 về mức hấp thụ clo của tôm. Tôm sau khi bóc vỏ và bỏ đầu được ngâm 30 phút trong dung dịch chứa 150mg/l HOCl tương đương với nồng độ clo tự do là 87 mg/l. Người ta thấy rằng 2% clo đã ngấm vào tôm, mà 3/4 của số đó nằm trong phần ăn được. Các sản phẩm phụ của clo chưa được xác định trong nghiên cứu này.

Trong báo cáo về an toàn hải sản của Cơ quan Dinh dưỡng và Thực phẩm Mỹ năm 1991 chưa có sự đánh giá nào về mức độ ô nhiễm khi sử dụng clo và các hợp chất halogen khác và người ta cũng chưa đánh giá được các nguy cơ liên quan đến sức khỏe con người. Vì vậy bất kỳ một sự đánh giá nào về các nguy cơ này sẽ phải dựa trên các thông tin từ các lĩnh vực khác nữa.